Uppsala är en cykelstad. Stor hänsyn har därför tagits till cyklister vid bygget av det nya resecentrumet.
Eftersom godsbangården har flyttats försvann ett område för cykelparkering på östra sidan. Detta har ersatts med nya cykelparkeringar, också på östra sidan.
I det nya resecentrumet anläggs flera nya cykelparkeringar, bland annat längs nya Stationsgatan och längs med halva gamla bussterminalen. Söder om Centralpassagen blir det också en ny cykelparkering.
Ny cykel- och gångpassage
En stor förbättring för cyklister är den nya cykel- och gångpassagen under bangården intill järnvägsstationen, Centralpassagen, som förbinder de östra och västra stadsdelarna.
Bättre cykelbanor
När Strandbodgatan är ombyggd kommer det att finnas gång- och cykelbanor på båda sidorna.
Vid Strandbodgatan byggs också en ny entré till plattformarna söderifrån.
Strax öster om Bergsbrunnagatan byggs en ny cykel- och gångbro över Strandbodgatan för förbindelsen norr-söder.
På grund av byggarbetena med den nya järnvägsbron över Strandbodgatan kommer gatan att vara avstängd för trafik mellan Kungsgatan och Bergsbrunagatan från september 2007 till slutet av 2011, men cyklister och gående kommer att kunna passera.